石斛對水分的需要量不大，在冬季，石斛處于休眠狀態，不需要過多水分，到生長發育季節，雨季來臨，靠吸收空氣中的水分就可以滿足需要，但是忌干旱。石斛生長地區年降雨量大多在1100毫米以上，我縣平均雨量可達到2100毫米以上，空氣相對濕度在80%以上。根系周圍的持水量達到30%就可以滿足需要。雖然石斛生長需要較高的空氣含水量，但怕水淹，雨季基質含水量處于飽和狀態，如果通氣不良，根的顏色為淺黃色或棕黃色，莖葉萎黃，長勢差，嚴重者葉片脫落，根系腐爛，莖上又長出瘦弱的新芽。這就是石斛喜潮濕又怕水性。

石斛根系屬于氣生根，無根毛，附著于樹干上，裸露在空氣中，才能健康生長，在通氣不良的環境中或長期處于較多水分狀態下，就會導致根的壞死，這是石斛與其它作物不同的"氣生"特殊性，根必須保證通氣性，石斛才能健康生長。根還不能處于嚴重腐爛環境和長期多水的條件下生存，因基質腐質化較深易積水，通氣差導致根的死亡。

野生石斛在自然條件下，根上共生著根菌，也稱根際微生物，屬真菌類。在石斛生長發育中由根菌固定空氣中的氮，分解附主上的動植物殘體來繁殖自身，菌絲伸到石斛根部死亡分解出石斛所需的營養物質供之生長發育，而不是直接從附主上吸收養分。根菌是石斛不可缺少的因素之一，類似豆科作物的根瘤菌。另外石斛種子的萌發需根菌提供營養，沒根菌的存在種子不能萌發成苗。根菌生長發育同樣需要氮、磷、鉀、鈣、鐵、硫、硼、鋅、銅、鉬、鈷、錳等多種營養元素，為根菌提供的營養就越豐富。另外石斛除與根菌共生獲得營養物質外，對肥料的吸收是低離子濃度吸收，這是與地生植物不同的另一特性"低離子濃度吸收性"。人工栽培時，還需要人為提供給石斛生長發育所需養分，才能確保石斛優質高產。

石斛是附生多年生草本植物，其根系附著于森林樹干上，裸露在空氣中。樹干起到的作用，一是固定石斛植株，二是間接為石斛提供水分和養分。它的生長靠裸露在空氣中的根系吸收空氣中的水分，固定空氣中的氮及靠根菌分解附主表皮及附主上的動植物殘體獲得營養物質進行生長發育，不像農作物一樣是直接從土壤中吸收生長發育所需的營養物質。附生性是石斛植物的共性。石斛不適宜在腐質化過重的附主上生長。