新鮮石斛汁多鮮嫩，容易腐爛變質，特別是霉雨季節，更不易保存。為了延長其食用時間，要用正確的方法保存。

新鮮的鐵皮石斛貯藏時最主要的是不能密閉。許多人怕新鮮鐵皮石斛失去水分，將鐵皮石斛密閉在塑料袋中，結果導致霉變。新鮮的鐵皮石斛在透氣條件下貯藏一年也不會腐爛，第二年還能在節上萌發新芽，枯而不死、僵而不爛也是其非常神奇的地方。

為了不讓其發芽，家中少量鐵皮石斛鮮品可用紙或布袋包裝后放入冰箱冷藏。帶葉品，先將葉莖分開后存于0-7℃條件下冷藏，可確保3個月內無變質；若服用期超過3個月，用保鮮袋包好后冷凍，可保存半年。不帶葉品真空包裝，于0-7℃條件下可保質2半月，于冷凍條件下可保存8個月。