由于石斛性微寒，脘痞腹脹，嘔惡便溏泄瀉，口淡不渴、胃酸分泌過少者都屬于脾胃虛寒，大量服用后會引起消化不良或腹瀉。石斛具有生津滋陰的作用，比較適合陰虛的人服用，脾虛濕盛者大量服用會滋膩礙胃，引起消化不良。

感冒初期不宜吃，由于鐵皮石斛偏于滋膩，服用后不利于感冒的治療。

病早期陰未傷者，濕溫病未化燥者，也就是說如果發熱，但沒有出現什么口大渴，大汗等損失體液的情況，屬于熱病早期陰未傷者不宜服用。頭昏脹痛、胸悶不舒、小便不利屬于濕溫病未化燥者也不可用，因為過度滋陰就會使上述病痛難以去除；更不可用。

根據中藥配伍原則，鐵皮石斛不宜與寒水石，巴豆，炒僵蠶等中藥同時使用，曾有藥理實驗證明，大劑量能抑制心臟，降低血壓，抑制呼吸。